Я вырастила рассаду цветов для балкона: настурция, бархатцы, агератум, календула, васильки, алиссум, петуния, однолетние флоксы. Вопрос: как лучше комбинировать эти цветы в балконных ящиках?

Я не дизайнер, а обычный любитель цветов.
Хочется уточнить:
Настурция какая - ампельная?
Агератум какой - карлик или выше?
А флоксы - какие (розовые махровые или звездочки)?
А календула...? Ну и так далее?
Все выращенные Вами цветы, с моей точки зрения, хороши в индивидуальной высадке да и то лучше в саду, а не на балконе. А комбинировать имеет смысл, когда высота равная (и ты убежден, что это именно так), Цветовые сочетания - это тоже вопрос? Я бы в ящиках оставила только петуньи, бархатцами можно кое-что оттенить? Флоксы, если махровые, могут оттенить пару-тройкы компактных кустиков низкорослых бархатцев, но ...

Если у Вас участка нет, то может в следующий раз вырастите махровые петунии, карликовые георгины, виолы крупноцветные, а в виде ампельной зелени можно все это украсить вьюнком домашним (плющом) или подобным домашним растением (поставить горшок прямо в балконный ящик - чуть-чуть прикопать).